Pinnularia gibba? partie 1

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TerraDz42
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Prénom : Jean Luc

Pinnularia gibba? partie 1

Message par TerraDz42 »

Bonjour à tous,

Ce post constitue la partie 1 de l’identification de diatomées provenant d’une culture sur fond de mare asséchée (Alt. 530m). A quatre dates différentes, parfois éloignées, un prélèvement a été passé sous l’objectif. Sur la série d’images récoltées, j’en ai extrait les moins mauvaises que je vous présente. Les diatomées sont dans leur jus.
Suit une succincte description accompagnée des mensurations de la valve. Enfin, la consultation de la littérature, vient aider à boucler une première conclusion.
Celle-ci pouvait être suffisante, mais j’ai souhaité ajouter une partie 2 dans le but de satisfaire ma curiosité, et de peut-être apporter un petit plus à cette conclusion.
Partie 1
pinnularia_gibba1.jpg
pinnularia_gibba1.jpg (164.2 Kio) Vu 1297 fois
Fig.1
Ref. _141525 – (Fig.1) Valve linéaire-lancéolée, au contour subtilement tri-ondulé, avec des extrémités subcapitées arrondies . Aire axiale s’élargissant progressivement des extrémités vers le centre, où elle forme un stauros en nœud papillon. Raphé droit, aux extrémités centrales légèrement fléchies dans le même sens, et dont les fissures terminales sont en forme de faucille . Plusieurs taches sont visibles près de la zone centrale, entourant le stauros. Stries 10/10µ, courtes et radiantes au centre, convergentes et plus longues près des sommets, à très convergentes après la constriction.
Longueur : 82,4µ largeur : 13,3µ.
pinnularia_gibba2.jpg
pinnularia_gibba2.jpg (117.37 Kio) Vu 1293 fois
Fig.2
Ref. JLD0070 – (Fig.2) Valve linéaire-lancéolée, au contour très légèrement tri-ondulé, avec des extrémités subcapitées et arrondies à cunéiformes. Aire axiale s’élargissant progressivement des extrémités vers le centre, où elle forme un stauros en nœud papillon. Raphé droit, aux extrémités centrales légèrement fléchies dans le même sens, dont les fissures terminales semblent en forme de faucille . Plusieurs taches sont visibles près de la zone centrale, entourant le nodule central. Stries 9/10µ, courtes et radiantes au centre, convergentes et plus longues près des sommets, à très convergentes après la constriction, où certaines ont tendance à être en accent circonflexe.
Longueur : 82,8µ largeur : 12,7µ.
pinnularia_gibba3.jpg
pinnularia_gibba3.jpg (132.82 Kio) Vu 1295 fois
Fig.3
Ref. JLD0083 – (Fig.3) Valve linéaire-lancéolée, avec des extrémités subcapitées arrondies. Aire axiale s’élargissant progressivement des extrémités vers le centre, où elle forme un stauros. Raphé droit, aux extrémités centrales légèrement fléchies dans le même sens, dont les fissures terminales sont hélas peu visibles. Plusieurs taches sont visibles de part et d’autre du nodule central. Stries 9/10µ, courtes et radiantes au centre, convergentes et plus longues près des sommets, à très convergentes après la constriction.
Longueur : 91,1µ largeur : 14,7µ.
pinnularia_gibba4.jpg
pinnularia_gibba4.jpg (151.13 Kio) Vu 1293 fois
Fig.4
pinnularia_gibba5.jpg
pinnularia_gibba5.jpg (223.03 Kio) Vu 1295 fois
Fig.5
Ref. JLD0084 – (Fig.4) Valve linéaire-lancéolée, avec des extrémités subcapitées arrondies. Aire axiale rhomboïdale, s’élargissant rapidement des extrémités vers le centre, où elle forme un stauros. Raphé droit, aux extrémités centrales légèrement fléchies dans le même sens, dont les fissures terminales sont hélas peu visibles sur la diatomée entière. Sur le crop d’un apex (Fig.5), la fissure terminale part en forme de point d’interrogation. Deux grandes taches sont visibles d’un côté du nodule central.
Stries 9/10µ, courtes et radiantes au centre, convergentes et plus longues près des sommets, dont certaines en forme d’accent circonflexe.
Longueur : 78,1µ largeur : 13,2µ.
_____
Les descriptions de ces 4 spécimens me semblent à peu près équivalentes, et leurs données morphométriques de base assez proches, mis à part la référence JLD0083, plus longue et plus large.

• Dans notre forum j’ai trouvé une diatomée très ressemblante, postée par JP.Claes : (http://www.lenaturaliste.net/forum/view ... nii#p62284) sous le nom de Pinnularia braunii var. Amphicephala (A.Mayer) Hustedt, mais retoquée par André en P.gibba. Piste que j’ai par la suite poursuivie.

• Sur le forum Mikroscopia, D.Voisin a posté une P.gibba :
(https://forum.mikroscopia.com/topic/7087-pgib/) dont l’aspect semble mettre fin à mes recherches, mais en comptant les stries, je trouve 16 stries pour 10µ ! Y aurait-il une erreur d’échelle ?

• Ma bibliothèque n’étant constituée, hélas, que du H.Germain. Page 252, la Planche 91 montre une série de P.gibba (n°4 à 16). La description évoque des valves d’allure très variable quelquefois « subcapitées », en général allongées, de 50 à 135µ par 8 à 12µ de large… Mes valves me semblent parfaitement subcapitées, mais leur largeur excède 12µ (de 12,7 à 14,7 µ).

En poursuivant sur le web :

Le rapport « Alga Flora of Korea.pdf » que l’on peut obtenir à l’adresse suivante :
https://docplayer.net/141573424-Algal-f ... korea.html ...montre à la page 43, sous le titre :16. Pinnularia gibba Ehrenberg 1843: 384 (Figs. 33, 34). Hustedt 1930: 327. f. 600. Krammer and Lange-Bertalot 1986: 423. pl. 189. f. 1. Noh 1991: 108. f. 38. Chung 1993: 289. f. 301. Krammer 2000: 93. pl. 68. f. 1.
...une série de 7 P.gibba, dont 3 se rapprochent de mes spécimen (E, F, G). Dans leur description de l’espèce on peut lire (merci les traducteurs en ligne):
« Valves rhomboïdales lancéolées, s'effilant progressivement vers les extrémités largement arrondies et subcapitées à capitées. Le raphé est latéral et étroit, les fissures extérieures du raphé sont légèrement ondulées, les extrémités centrales du raphé sont élargies et pliées dans une direction, les pores centraux sont arrondis et rapprochés. Les extrémités du raphé ont la forme de grands points d'interrogation. Surface axiale 1/2-2/3 de la largeur de la valve, s'élargissant des extrémités vers le centre pour former une grande zone hyaline rhomboïdale et un fascia jusqu'aux marges. Quatre grandes marques sont généralement apparentes dans la zone centrale hyaline. Stries 8-11 rangées sur 10 μm, radiées au milieu et convergentes aux extrémités. Lignes longitudinales absentes à travers les stries. Valves 60-110 μ m de longueur et 10-13.5 μ m de largeur. »
Points + : La limite de largeur va au-delà de celle donnée par H.Germain, 13,5 contre 12µ. Mais pas encore suffisant pour ma référence JLD0083.
La zone centrale de mes 4 spécimens est également tachée.

Trouvé dans : International Journal of Ecology and Environmental Sciences (http://www.ecologyjournal.in/archives/2020.v2.i3.55) Online ISSN: 2664-7133;Print ISSN: 2664-7125; Impact Factor: RJIF 5.28Received: 18-06-2020; Accepted: 04-07-2020; ; Published: 19-07-2020Volume 2; Issue 3;2020;Page No. 59-66.
A systematic account of freshwater diatoms of Kerala, India : Potential source as live feeds in larviculture and biodiesel Aswathy Krishnan1, Aneykutty Joseph2*1-2Department of Marine Biology, Microbiology and Biochemistry,School of Marine Sciences,Fine Arts Avenue,Cochin University of Science and Technology,Cochin, Kerala, India

...page 60 Table 1 Sl. 25 Pinnularia gibba Linear-lanceolate Longueur 60-90µ largeur 11-14µ stries 10-11/10µ.
Encore un petit effort et les dimensions de mes spécimens vont rentrer dans la fourchette !

Lu sur : Archives de la thèse finale : Barbora Chattová Faculté des sciences N-BI BISE (B), Taxonomie et écologie des diatomées d'eau douce de l'île de New Amsterdam (TAAF, Sud de l'océan Indien). …(https://is.muni.cz/th/150958/prif_m/master_thesis.pdf), page 16 :

« Pinnularia amsterdamensis appartient au groupe de taxons autour de Pinnularia gibba Ehrenberg, bien que P. gibba lui-même puisse être très facilement distingué sur la base des marques irrégulières dans la zone centrale, les apex capités plus grands et plus prononcés et les stries courtes résultant en une large zone axiale. ».
Deux articles de la littérature mentionnent donc des taches sur la zone centrale du frustule de P.gibba.

Je pourrais donc à ce stade proposer Pinnularia gibba, sur les arguments suivants :

• dimensions qui collent à un poil près avec les standards,
• apex subcapités,
• aire axiale qui s’évase des apex à la zone centrale,
• présence d’un stauros,
• raphé droit, aux extrémités centrales qui s’incurvent dans le même sens, et dont les fissures terminales sont en forme de faucille,
• stries courtes, radiantes au centre, convergentes aux extrémités,
• densité de stries conforme aux fourchettes,
• taches près du nodule central.

Cependant j’ai voulu pousser un peu plus loin en tentant une analyse factorielle, avec le secret espoir de voir mes spécimens proches d’un nuage de points constitué par d’autres P.gibba. Je ne suis en rien un spécialiste des statistiques, mais très loin dans le temps, j’avais pratiqué ponctuellement l’Analyse en Composantes Principales, alors j’ai décidé de m’offrir une petite « récréation », peu importe le résultat, qui sera décrite dans la Partie 2 de mon prochain post !

Bonne soirée à tous,

Amicalement,

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Re: Pinnularia gibba? partie 1

Message par Buteo »

Bonjour Jean-Luc,
Ben dis donc tu t'es lâché !
TerraDz42
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Re: Pinnularia gibba? partie 1

Message par TerraDz42 »

Bonjour Philippe,

...oui, j'ai le sentiment d'avoir été moins fainéant que d'habitude.... mais qu'est-ce-que ça épuise !!!! :(

...et je te raconte pas la deuxième partie !
Jean Luc
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André
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Re: Pinnularia gibba? partie 1

Message par André »

Bonjour à tous, Jean Luc

Je suis admiratif devant ce travail , étude de ces specimens!!

Pour moi, pas de doutes pour Pinnularia gibba
Dans Diatoms of Europe, Krammer, P.gibba est longue de 60 - 110µm et large de 10 - 13.5µm
Les stries sont au nombre de 8 - 11/10µm.
C'est ce que tu as relevé en fouillant le web.
Effectivement la réf.JLD0083. dépasse la limite supérieure de la largeur. Hustedt "monte" jusqu'à 14µm pour P.gibba et var....

La suite en partie 2 ....
Amicalement
André Advocat

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Re: Pinnularia gibba? partie 1

Message par TerraDz42 »

Bonjour André, à tous,

Merci pour tes encouragements et tes précieux commentaires !

JLD0083 serait-elle une var. de P.gibba ?..

Bon week-end,

Cordialement,

Jean Luc
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