Macro au microscope

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 23 Déc 2017 08:11

[suite]

Et puis ces nouveaux réglages ne sont pas forcément valables pour tous les sujets :

La comparaison entre le premier et le second réglage :
2a (2)-OLD and NEW-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 2a (2)-OLD and NEW-LG.jpg (116.54 Kio) Vu 2095 fois


Pour ma part je préfère ma première image...

C'est bien compliqué !


Pour le plaisir des yeux voici quelques autres de mes essais marins :
Moll 2c 22-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Moll 2c 22-LG.jpg (110.11 Kio) Vu 2095 fois


Moll 6a 22-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Moll 6a 22-LG.jpg (119.43 Kio) Vu 2095 fois


Moll 10 15-Proto-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Moll 10 15-Proto-LG.jpg (120.2 Kio) Vu 2095 fois


Bryo 5-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Bryo 5-LG.jpg (152.76 Kio) Vu 2096 fois
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede Fredlab » 23 Déc 2017 12:07

Hello

C'est cool cette technique.
Amha, il reste encore à adoucir un peu la lumière.
(et puis voir comment tu peux réduire un peu le grain dans le rendu final... mais là, je n'ai pas la solution pour le moment)

Merci pour le partage.
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Re: Macro au microscope

Messagede André » 23 Déc 2017 12:30

Bonjour à tous

Je trouve tes résultats vraiment convaincants et note qu'il n'y a même pas d'aberrations chromatiques !
C'est vrai qu'il y a du grain, mais à 1600 ISO c'est un peu normal !
Comme les sujets ne bougent pas, essayer avec une vitesse plus lente afin de ramener les ISO à 800 ?
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Re: Macro au microscope

Messagede Dutilleul9 » 23 Déc 2017 12:43

Bonjour ,

Oh c'est beau ! Et, quel chance de ne pas avoir les aberrations chromatiques, as-tu utisé A.photoshop pour ça Sylvain et peux-tu me
dire si tu as une procédure fastoche ? Merci :)
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Re: Macro au microscope

Messagede -Stéphane- » 23 Déc 2017 18:00

Bonsoir,

Les résultats sont excellents. Bravo!

Je rejoins Frédéric sur la dureté de la lumière. Un petit morceau de papier calque (ou papier de soie, voir papier de cigarette?) scotché devant chaque lampe devrait diffuser un peu la lumière et limiter les reflets.


Bonne continuation.
-Stéphane-
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 24 Déc 2017 08:14

Merci à tous pour vos commentaires.

Effectivement, la dureté de la lumière nécessiterait que j'ajoute des diffuseurs, car pour l'instant je ne joue qu'avec l'angle d'éclairage. Faut dire que mon installation est minimaliste comme montré ci-dessus. :grat:

En ce qui concerne les aberrations chromatiques, je ne fais rien de spécial... Je suppose que le x4 plan que j'utilise est simplement bon pour cet usage ! :mrgreen:

La qualité des images est telle, que le post-traitement est minimaliste : recadrage, lumière + contraste, ajout de l'échelle et basta !
J'ai conservé de mon approche ancienne, la volonté de mettre en évidence ce qui doit l'être pour servir le sujet, pas forcément de belles images bien léchées. Il se trouve que l'un n'empêche pas l'autre... :D

La lecture de l'ouvrage de Fred et Daniel sur la macro au delà du rapport 1/1 est riche d'enseignements tout à fait utilisables (c'est d'ailleurs la volonté délibérée des auteurs que de proposer systématiquement de l'utile). Je ne saurai trop vous le recommander. Pour ma part, je suis en train de l'apprendre par coeur ! :mrgreen:

Il me reste pas mal de chose à expérimenter pour améliorer encore les choses, mais je souffre d'un handicap certain avec mon alimentation électrique restreinte : je ne peux passer du microscope au PC pour visualiser la pertinence de mes expérimentations, car le PC consomme 40W et le ban photo seulement 2. Du coup je fais des séries de milliers d'images en zédification, avant d'en visualiser le résultat... :mrgreen:

Mon réglage optimum actuel est à 640 ISO, vitesse 8 (-3).
Amicalement

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 25 Déc 2017 08:24

Bonjour à tous

j'ai donc placé des bavette de papier sur mes éclairage pour ces essais.

En ce qui concerne la lumière, le réfléchissement demeure, même s'il est moindre, comme l'attestent ces images de Foraminifère à surface lisse translucide, porcellané... (tout pour plaire ! :mrgreen: ) :
0 Foram 3a 800 ISO 1,2 (-3)-37-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 0 Foram 3a 800 ISO 1,2 (-3)-37-LG.jpg (83.82 Kio) Vu 1952 fois

Le repositionnement des images pour la présentation correcte de l'espèce, donne une légère bizarrerie au niveau de l'orientation des éclairages...

Sur une espèce plus mat, le résultat est sans surprise meilleur :
0 Foram-800 ISO 1,2 (-3)-26-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 0 Foram-800 ISO 1,2 (-3)-26-LG.jpg (99.66 Kio) Vu 1952 fois



J'ai aussi comparé les images en poussant à 800 ISO, vitesse 1,2 (-3), puis 1000. vitesse 6 (-3)

Un Mollusque assez mat, victime d'une prédation par un jeune Murex, une Scissurella costata dont la fente siphonnale est refermée (cela arrive lors des pauses de croissance) :
0 Scissurella ISO-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 0 Scissurella ISO-LG.jpg (120.09 Kio) Vu 1952 fois


Et le plus petit oursin régulier que je n'ai jamais observé, un jeune tellement jeune que les ouvertures sont énormes :
0 Oursin ISO-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 0 Oursin ISO-LG.jpg (98.33 Kio) Vu 1953 fois



A 800 ISO, j'obtiens des couleurs et une visibilité des reliefs bien meilleurs qu'au-delà. Mais la moindre visibilité dans les oculaires rend la mise au point plus délicate. Depuis que j'ai vu l'installation de Michel, je rêve d'en faire autant..., mais pas dans le camion... :grat:
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 15 Jan 2018 08:17

Bonjour à tous !

J'ai quasi fini d'éponger mes 10.000 clichés de zédification. Ouf ! :D

Chemin faisant, j'essaie de nouveaux trucs...

Voici un objet ovoïde brillant, un Foraminifère méditerranéen actuel, qui m’a donné bien du fil à retordre.
Une vue d’ensemble au x4 pour commencer. On devine du coté de l’apex une sorte de structure :
40 x4-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 40 x4-LG.jpg (297.05 Kio) Vu 1827 fois


Avec le x10, les reflets restent gênant :
40b 24 x100LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 40b 24 x100LG.jpg (125.75 Kio) Vu 1827 fois



Voici au x10 un test réalisé avec les méthodes C et B d’Hélicon Focus avec comme post-traitement juste un coup de contraste automatique. On distingue clairement la structure de la rosette centrale, mais la zédification par le logiciel a tendance à étendre les reflets :
40 comaratif 2 méthode Helicon x10-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 40 comaratif 2 méthode Helicon x10-LG.jpg (83.44 Kio) Vu 1827 fois



N’ayant peur de rien, j’ai fait l’essai avec le l’objectif x20. La structure de la rosette est ce coup ci mieux visible avec la méthode C :
40 comaratif 2 méthode Helicon-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 40 comaratif 2 méthode Helicon-LG.jpg (83.62 Kio) Vu 1827 fois



En guise de conclusion :
Ces images sont surement suffisantes pour déterminer l’espèce, mais elles ne possèdent pas les qualités esthétiques que j’espérai.

Quant à Hélicon Focus, il y a tout intérêt à travailler l’éclairage en amont, car le logiciel patauge avec les reflets en les étendant. A ce titre les deux méthodes s’avèrent décevantes et, comme l’a conclu Fred ailleurs, l’usage de la méthode C est la seule qui soit utile pour ce type d’objets (pour tous d’ailleurs !).

En fait, plus j'avance dans ces techniques, et en photo de microscopie en général, plus je me rends compte que chaque sujet doit être traité de façon unique, qui nécessite des allers/retours entre l'écran et le microscope. A ce titre, la solution de Michel avec son écran relié en hdmi à l'APN me semble le must.
L'abatage en série tel que je le pratique est à proscrire. Mais l'espace réduit dans lequel je travaille, les contraintes de consommation électrique qui y sont inhérentes, ne me permettent pas de traiter les images comme il le faudrait... Et je ne vous parle pas de la résolution d'écran mise au minimum et de ses effets pervers lors du post-traitement...

Arghhh..., si je veux progresser, il va me falloir un vrai labo sessile : prendre un appart pour m'y faire un vrai poste de travail ! J'y réfléchi sérieusement.
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede michelflashman » 15 Jan 2018 11:11

Bonjour Sylvain,

10 000 clichés ???? Pour zedification !!

N'est ce pas un peu excessif !

Tu as developper une usine a gaz !! Avec tout mon respect.

Comme traiter de telle volume ? Tu manques d'energie ?

Tu envisage un labo dans un appart !!

Quel est donc l'ordi qui avale tout cela.

Combien de temps pour sortir une photo fini .(au demeurant , souvent, excellente !!

Je crois que tu n'as pas pris le bon chemin !!! Tu files droit sur une impasse !!

A mon point de vue , naturellement .

Il faut savoir utiliser les techniques nouvelles qui permettent des miracles avec un cout , calcul complet, bien moins cher .

Et en plus je risque de me retrouver le seul nomade du forum !!!!

Amicalement

Michel

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 16 Jan 2018 10:05

Bonjour àtous !

michelflashman a écrit:Bonjour Sylvain,

10 000 clichés ???? Pour zedification !!

N'est ce pas un peu excessif !

Tu as developper une usine a gaz !! Avec tout mon respect.

Comme traiter de telle volume ? Tu manques d'energie ?

Tu envisage un labo dans un appart !!

Quel est donc l'ordi qui avale tout cela.

Combien de temps pour sortir une photo fini .(au demeurant , souvent, excellente !!

Je crois que tu n'as pas pris le bon chemin !!! Tu files droit sur une impasse !!

A mon point de vue , naturellement .

Il faut savoir utiliser les techniques nouvelles qui permettent des miracles avec un cout , calcul complet, bien moins cher .

Et en plus je risque de me retrouver le seul nomade du forum !!!!

Amicalement

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Heu... tu as surement raison Michel, mais personnellement je sors du cadre de ton raisonnement pour des raisons..., euhhh..., personnelles ! :mrgreen:


L’énormité des chiffres est toute relative et cache une raison sous-jacente que j’exposerai à la fin de ce bilan :
Le décompte exact des images :
1400 images le 15 12
2000 images le 16 12
2300 images le 17 12
Soit 5.700 images pour sortir 322 résultats… insatisfaisants !
Puis 5.634 lors de la suite…
Puis 1.610 le 28 12
Soit 7.234 pour cette suite en deux temps

Donc un total de 12.934 images réparties en :
1 espèce de Brachiopode, soit 22 images de travail
18 espèces de Bryozoaires, soit 57 images de travail
11 espèces de Crustacés, soit 27 images de travail
14 espèces de d’Échinodermes, soit 46 images de travail
43 espèces de Foraminifères, soit 241 images de travail
9 formes indéterminées, soit 27 images de travail
75 espèces de Mollusques, soit 323 images de travail
3 espèces de Poissons, soit 8 images de travail
5 espèces de d’Annélides, soit 9 images de travail
Spicules de Spongiaires, 6 images de travail.

Total : 190 sujets répartis en 766 images de travail.

Sachant que les Foraminifères nécessitent généralement un recto/verso, voire des prises de vue à différents grossissements, que les Mollusques Gastéropodes demandes généralement 3 angles de prise de vue, voire 4 ou plus si on s’essaie à mettre en évidence la protoconque, je trouve que ce n’est pas tant de travail que ça au final…
Et puis l’insatisfaction face à certains résultats m’a poussé à recommencer encore et encore parfois, et ne n’ai pour l’instant rien jeté !

Et le pire dans tout ça, c’est que je vais recommencer à nouveau lorsque j’aurai une station de travail qui me permettra de faire la mise au point de l’APN à l’écran… Il me semble aujourd’hui que c’est la seule méthode qui permette d’affiner les réglages de l’éclairage et de l’APN et qui permet d’assurer au final une image de haute qualité.

Alors oui, je suis un stack-hanoviste , mais j’ai parfaitement conscience que ce sont les heures que l’on passe qui permettent de com-prendre, c’est-à-dire de prendre avec soi, afin de progresser.

Je n’avais jamais rêvé, par exemple, de voir aussi clairement les pores par lesquels sortaient les pseudopodes de ce Foraminifère posé sur la tranche (à droite)…, mais je pense illico que je dois pouvoir faire mieux !
27-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 27-LG.jpg (129.24 Kio) Vu 1743 fois

27c 32 x100 méthode c 2-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 27c 32 x100 méthode c 2-LG.jpg (165.16 Kio) Vu 1743 fois


La raison sous-jacente à cette boulimie, c’est ma volonté de me préparer quelque chose à faire pour cette période d’immobilisation forcée, plus de 12 semaines, qui suivra mon opération à cœur ouvert… Ma hantise du vide m’a poussé à conserver 160 sujets pyrénéens et ces images d’organismes marins, qui, je l’espère, vous feront comprendre l’amour que je leur porte depuis si longtemps !

Cette opération initialement prévue en janvier est repoussée de semaines en semaines… Qu’importe, pendant ce temps, j’avance !


Quant au nomadisme intégral, il est quelques peu limitant pour mes activités. J’ai toujours préféré le semi-nomadisme qui permet de décharger les récoltes et d’assurer leur traitement avec de bons outils. C’est vers cette solution idéale, à mes yeux, que j’entends retourner, en sortant du trou financier dans lequel je suis malencontreusement tombé. J’y travaille !
Amicalement

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