Macro au microscope

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 26 Nov 2017 07:13

Bonjour à tous !

Voici de nouveaux essais réalisés sur des fleurs mâles en formation (précoce) de Genévrier oxycèdre (Juniperus oxycedrus).
J’ai un peu bricolé dans le camion et je travaille à présent avec deux sources lumineuses.

Premier essai : x4, pile de 24 images :
1a-24-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 1a-24-LG.jpg (124.93 Kio) Vu 1717 fois


Pour les essais suivants, j’ai voulu comparer les réglages manuels et ceux de l’IA intégrée :
Voici donc une pile de 33 images en réglage manuel suivi d’une pile de 30 images dont les réglages ont été confiés à l’IA.

[je n’ai pas détouré la première image, car je veux pouvoir me souvenir que le reflet sur la plaque de verre peut provoquer ce que l’on aperçoit en haut à droite : un reflet diffracté !]

Réglages manuels :
2b-33-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 2b-33-LG.jpg (180.46 Kio) Vu 1718 fois


Réglage de l'IA :
2c-30-IA-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 2c-30-IA-LG.jpg (188.15 Kio) Vu 1717 fois



Enfin, sur une feuille proche des fleurs, j’ai trouvé ce que je pense être une Cochenille.
Pile de 14 images, x10 :
1a-14-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 1a-14-LG.jpg (200.42 Kio) Vu 1717 fois



Comme prévu, l’ajout d’un second éclairage fait nettement gagner en qualité.
Pour le comparatif entre IA et les réglages manuels, je ne sais pas trop : il me semble que c’est affaire de gout…, moi je préfère l’image obtenue en manuel ! Elle me semble plus proche de l’observation à l’œil.

Quand à la cochenille, les brillances qui apparaissent sont aussi ce qui permet de mettre en évidence les reliefs de la carapace…


En tout cas, je suis vraiment content, jamais je n’aurai pensé être en mesure de produire de telles images !

Encore merci pour cette générosité à laquelle je le dois... :prost:
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede BINO-BONI » 26 Nov 2017 18:24

Bonjour Sylvain

La qualité de tes images progresse à la vitesse Grand V! mais explique moi en quoi consiste les réglages IA de ton appareil?
Une remarque: le détourage parait un peu violent (limite trop brutales entre la zone détourée et le fond), ce qui donne de la dureté et tend à retirer le côté naturel de tes objets. Les champions de Photoshop pourront t'expliquer le mode opératoire pour améliorer cela. Je croix que c'est une question du nombre de pixels de la bordure du pinceau, à confirmer.
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 27 Nov 2017 07:35

Bonjour Jean-Claude

BINO-BONI a écrit:La qualité de tes images progresse à la vitesse Grand V! mais explique moi en quoi consiste les réglages IA de ton appareil?

En mode IA (intelligence artificielle) l'appareil s'occupe d'optimiser seul tous les réglages : vitesse, exposition, etc...


BINO-BONI a écrit:Une remarque: le détourage parait un peu violent (limite trop brutales entre la zone détourée et le fond), ce qui donne de la dureté et tend à retirer le côté naturel de tes objets. Les champions de Photoshop pourront t'expliquer le mode opératoire pour améliorer cela. Je croix que c'est une question du nombre de pixels de la bordure du pinceau, à confirmer.

Je sais pour t'avoir lu ailleurs, que tu n'aimes pas trop les images trop propres par leur coté artificialisation... Le détourage est un choix, surtout quand les fonds sont vilains..., ou naturellement pour des sujets tels que les mollusques. Insérer une zone progressive entre le sujet et le fond reviendrait soit à laisser une marge variable autour du sujet, soit à altérer la bordure même du sujet. Dans les 2 cas, le résultats ne me séduit pas.

Paüle, qui artificialise complètement ses fonds, utilise une technique progressive d'un coté de la diatomée pour lui donner de la profondeur, comme dans cet exemple. Mais je ne vois pas vraiment comment l'utiliser sur ces fleurs d'oxycèdres...

Ceci dit, c'est affaire de gout et je n'ai fait aucun essai avec une autre teinte que le noir. Peut-être que pour certains sujets je pourrais tenter autre chose.


Mais bon là, j'en suis encore au stade de l’émerveillement des essais et c'est plutôt la netteté et l'éclairage qui me motivent, plus que le post-traitement... :D
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 29 Nov 2017 09:49

Bonjour à tous,

j'ai récupéré des petits morceaux de cuir colorés et fait quelques essais sur des graines.

Allium ursinum Linné, 1753 - Ail des ours (Amaryllidaceae) [piles de 27 et 29 images, x4)
1a-27-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 1a-27-L.jpg (247.61 Kio) Vu 1527 fois

1b-19-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 1b-19-L.jpg (263.54 Kio) Vu 1526 fois



Lavandula angustifolia Miller, 1768 - Lavande officinale (Lamiaceae) [piles de 13 et 17 images, x4)
Lavandula angustifolia-6a-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Lavandula angustifolia-6a-L.jpg (218.64 Kio) Vu 1528 fois



Bon, indépendamment de l’effet esthétique, je vous le dis tout net, je n’irai pas plus loin avec cette approche, car cela rend tout détourage compliqué, et cela nécessiterai de s’emm… grave la vie en plaçant le fond dans le même fil… (car j’avais aussi pensé à faire des essais avec du bois…).

J’ai donc préparé une lame de verre et une micro-table sur bille et aimant, peints en noir mat, et je vais chercher un autre support coloré uniformément pour les objets sombres, couleur genre abricot. Car le détourage n’est pas seulement une façon d’isoler un objet, mais aussi une technique qui permet d’agencer ses différentes faces sur la même image.
Ceci étant dit, il serait tout à fait possible de préparer de belles images de fond, puis d'y coller les objets détourés. Mais c’est un travail en aval qui n’a rien à voir avec la saisie initiales des images.
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 02 Déc 2017 07:40

Bonjour à tous.

En allant au magasin de bricolage du coin, j'ai pris quelques lèches de teintes de peinture, qui sont constituées de teintes mates imprimées sur support plastiques souples mais un peu épais. En découpant certaines teintes qui contrastent fortement avec mes sujets, j'ai obtenu des images facilement détourables, comme ces images de graines de Capsicum chinense qui ont fait l'objet de ma récente devinette.

Pour les graines sombres j’ai choisi un fond orangé, comme pour ces graines d’Arbousier (Arbutus unedo Linné, 753), zédification de 31 et 22 images, x4 :
Arbutus unedo-6a-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Arbutus unedo-6a-L.jpg (182.98 Kio) Vu 1450 fois

Arbutus unedo-6b-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Arbutus unedo-6b-L.jpg (209.82 Kio) Vu 1448 fois


Graines de Ciboulette (Allium schoenoprasum Linné, 1753), zédification de 29 et 47 images, x4 :
Allium schoenoprasum-6a-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Allium schoenoprasum-6a-L.jpg (194.89 Kio) Vu 1448 fois



Pour les graines claires, j’ai choisi un gris et un mauve.
Ici des graines de Physalis pubescens Linné, 1753, zédification de 17 et 10 images, x4 :
Physalis pubescens-6a-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Physalis pubescens-6a-L.jpg (143.75 Kio) Vu 1448 fois


Graines de Lyciet commun (Lycium barbarum Linné, 1753) sur fond gris, zédification de 12 et 15 images, x4 :
Lycium barbarum-6a-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Lycium barbarum-6a-L.jpg (139.82 Kio) Vu 1448 fois
Amicalement

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 02 Déc 2017 07:41

[suite]


Un des avantages de ces lèches (outre qu'elles sont gratuites !), c’est que l’on peut réaliser des images de ces fonds colorés, avec une mise au point bien floue, pour s’en servir de fond pour y coller des sujets détourés et ainsi éliminer le grain du fond et les ombres portées, comme par exemple (vite fait sur un des seuls fonds photographiés) cette graine au joli motif spiralé de Physalis (zédification de 29 images, x4) (l’irrégularité des contours sombres fait partie de l’image originale) :

Physalis pubescens-6c-L.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Physalis pubescens-6c-L.jpg (198.14 Kio) Vu 1443 fois



La saison ne se prêtant pas aux observations de graines sur le terrain, j’ai eu accès à une collection de semences. J’ai eu la surprise de découvrir que certaines graines présentent des structures fort surprenantes et/ou esthétiques. De cette expérimentation je conserverai une curiosité plus soutenue pour les observer… de près ! :mrgreen:
Amicalement

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 18 Déc 2017 08:32

Bonjour à tous,

j'ai retrouvé un vieux prélèvement réalisé dans une grotte sous marine et je viens d’enchainer quelques 3.500 photos de zédification... et ce n'est pas fini... :D

L'occasion pour moi de vous présenter les premières images retravaillées en attente de détermination, du moins pour les espèces que je connais.

Scissurella cf. costata : je ne suis pas très satisfait, car mal définie (x4, zédification de 18 images)
Scissurella cf costata-4b-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Scissurella cf costata-4b-LG.jpg (115.36 Kio) Vu 1298 fois


Un Foraminifère (je n'ai pas sous la main le bouquin qui dort quelque part dans un carton ! :mrgreen: ) (x4, zédification de 14 images)
Foram 07-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Foram 07-LG.jpg (119.26 Kio) Vu 1296 fois


Un brachiopode dont je ne suis pas certain de la détermination car il ne correspond pas tout à fait à la description de Megathiris detruncata (Gmelin, 1789) :grat:
Brachio 1a-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Brachio 1a-LG.jpg (113.43 Kio) Vu 1299 fois


Détail du précédent (x10, zédification de 21 images :
Brachio 1b-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Brachio 1b-LG.jpg (107.65 Kio) Vu 1298 fois


Et une vertèbre de poisson (x10, zédification de 19 images) :
Poisson 1-19-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Poisson 1-19-LG.jpg (74.97 Kio) Vu 1298 fois



Le vent qui fait trembler le camion, ma respiration même, provoquent des micro-mouvements qui floutent certains sujets..., c'est pas gagné ! :mrgreen:
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 20 Déc 2017 07:37

Bonjour à tous,

J'ai passé du temps sur mon sédiment marin, quelques 5.700 clichés pour arriver à 322 images...
Je me suis aperçu un peu tard qu'avec l'objectif x4 je n'étais pas parfocal, les trois premiers clichés étant flous, et me manquant à l'autre bout de la chaine 3 clichés de netteté dans la partie basse de l'objet.
Curieusement, le phénomène est moins important avec le x10 et absent lorsque j'utilise le x20 pour des détails... Apprendre par l'erreur..., un principe qui dure ! :mrgreen:

Pour le fun, je vous propose aujourd'hui quelques images zédifiées de foraminifères qui sont, pour l'instant, indéterminés.

(x4, zédification de 19 images) :
Foram 03-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Foram 03-LG.jpg (139.68 Kio) Vu 1178 fois


(Panoramique de 2 images assemblées par ICE, x10, zédification de 19 images) :
Foram 03b-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Foram 03b-LG.jpg (141.25 Kio) Vu 1178 fois


(x20, zédification de 33 images) :
Foram 03c-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Foram 03c-LG.jpg (109.05 Kio) Vu 1177 fois



(x4, zédification de 9 images) :
Foram 16c 9-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Foram 16c 9-LG.jpg (126.21 Kio) Vu 1178 fois


Et pour finir, du moins pour aujourd'hui (x4, zédification de 11 images) :
Foram 11c 11-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Foram 11c 11-LG.jpg (122.82 Kio) Vu 1177 fois




Je trouve les résultats impressionnant, mais c’est surtout en raison des sujets…, car si l’on regarde dans le détail, il y a des zones de flou qui, avec plus de rigueur, n’auraient pas eu lieu d’être… :oops:
Amicalement

Sylvain
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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 20 Déc 2017 07:57

Bonjour again !

Voici mon installation en action dans le camion :
Macro au micro-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Macro au micro-LG.jpg (165.09 Kio) Vu 1173 fois


- A gauche la bino qui permet de sélectionner les sujets à photographier.

- sur la platine du microscope, une lame de verre grand format peinte en noir mat à la bombe avec les objets sélectionnés en attente.

- de part et d'autre du microscope les deux Jansjö à pince qui éclairent les sujets

- en bas à droite la télécommande qui permet de déclencher l'APN (merci Fred :D )

- Tout en haut, la multiprise fixée qui alimente tout ce qui est ici électrique, y compris l'APN (merci Fred again !)

- sur le condensateur du microscope les fonds colorés qui me permettent de contraster les objets sombres. (avec une micro-boulette de patafix qui permet de positionner les objets dans la position souhaitée. Il existe de la blanche et de la noire, cette dernière, grossie, étant plutôt grise)


Vous remarquerez le raccord de haute technologie qui permet de relier l'APN au microscope... :mrgreen:
Amicalement

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Re: Macro au microscope

Messagede 6le20 » 23 Déc 2017 08:11

Bonjour à tous !

Les petits objets vitreux, à la fois semi-transparents et réfléchissants, posent des problèmes spécifiques tout à fait particuliers...
Il m'a fallu recommencer les zédifications avec de nouveaux réglages en poussant les ISO à 640 de façon pifométrique... Jusqu'où d'ailleurs peut-on pousser avec ces APN modernes ??? (Lumix G5).


Voici l'image brute d'un foraminifère globuleux sans aucun post-traitement, d'une pile (insuffisante) de 12 images (x10). Les reflets lumineux étoilés me gênent un peu, mais je ne vois pas comment les supprimer totalement :
1h-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 1h-LG.jpg (68.59 Kio) Vu 1079 fois



Un autre exemple avec une structure très complexe d'un foraminifère dont les pores sont situés à l'extrémité de tubes allongés finement échinulés.
Ma première image était tout à fait inexploitable (pile de 19) :
5xa OLD 12a 19-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 5xa OLD 12a 19-LG.jpg (92.19 Kio) Vu 1078 fois


J'ai donc repris mon unique sujet avec les nouveaux réglages (piles de 34 et de 44) :
5x NEW5a 34-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 5x NEW5a 34-LG.jpg (92 Kio) Vu 1078 fois

5x NEW5b 44-LG.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 5x NEW5b 44-LG.jpg (113.33 Kio) Vu 1077 fois



C'est évidement nettement mieux, même si une partie de l'architecture demeure difficilement discernable... comme les tubes situés sur la face dorsale du sujet.
Je ne vois pas comment améliorer encore les choses ??? Auriez vous une idée à me suggérer ?


Pour la petite histoire, j'ai cru avoir déterminé le genre de ce dernier Foraminifère lorsque j'ai trouvé cette image :
5x Challenger-ORY.jpg
Exif et Meta MicroCartouche 5x Challenger-ORY.jpg (88.06 Kio) Vu 1077 fois


Mais il est étiqueté : Unknown sp. dans le rapport du Challenger... [The identification is based upon:
Jones, Robert Wynn, 1994: The Challenger Foraminifera Book Oxford Univ Press 416 pp. Plate 73, Fig. 17]

Agaçant, non ?
Amicalement

Sylvain
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