Le Naturaliste

Bonjour à tous,

Il existe de plus en plus d'applications permettant d'identifier des plantes, des insectes, des oiseaux, des chants basées sur des algorithmes d'intelligence artificiel.
Elle ne sont pas toujours convaincantes mais deviennent avec le temps de plus en plus fiable grâce à l'alimentation en photos faite par les différents utilisateurs. Je suis de plus en plus bluffé par PlantNet qui très souvent donne de bons résultats.
Tout ce préambule pour vous demander si vous connaissez des applications semblables pour les zoo et phytoplanctons ?

Cordialement.

Daniel

Bonjour,
plantnet donne en effet des résultats parfois bluffants, parfois comiques!
Cela nécessite toujours confirmation avec d'autres sources. Mais il faut avouer que cela peut fonctionner plus rapidement que le parcours de clefs dichotomiques (surtout si le parcours d'analyse demande par exemple des fruits que l'on n'a pas...)

Je ne pense pas qu'il faille limiter l'usage de ces outils aux débutants.
Au contraire les débutants sont ceux qui peuvent le plus être induits en erreur par manque de recul.

Pour le zoo et le phytoplancton, peut être pourrait on au sein du forum alimenter une base d'images qui couplée à un logiciel d'IA pourrait être un embryon d'outils?
Nous avons déja une base d'images déterminées. Il faudrait trouver un logiciel d'IA utilisable par un non spécialiste ou trouver l'ensemble logiciel IA et informaticien formé à ce logiciel...

Daniel a écrit:Bonjour,
plantnet donne en effet des résultats parfois bluffants, parfois comiques!
Cela nécessite toujours confirmation avec d'autres sources. Mais il faut avouer que cela peut fonctionner plus rapidement que le parcours de clefs dichotomiques (surtout si le parcours d'analyse demande par exemple des fruits que l'on n'a pas...)

Je ne pense pas qu'il faille limiter l'usage de ces outils aux débutants.
Au contraire les débutants sont ceux qui peuvent le plus être induits en erreur par manque de recul.

Pour le zoo et le phytoplancton, peut être pourrait on au sein du forum alimenter une base d'images qui couplée à un logiciel d'IA pourrait être un embryon d'outils?
Nous avons déja une base d'images déterminées. Il faudrait trouver un logiciel d'IA utilisable par un non spécialiste ou trouver l'ensemble logiciel IA et informaticien formé à ce logiciel...

Bonjour Daniel,

Ce serait effectivement génial comme idée, mais je ne connais personne travaillant dans ce domaine. Quelqu'un sur le forum ?
Proposition à creuser en tout cas.

Amicalement.

Daniel

Le logiciel LOBE , me parait tout à fait adapté pour une tel projet.

pierre4fun a écrit:Le logiciel LOBE , me parait tout à fait adapté pour une tel projet.

Merci Pierre,

Je vais explorer un peu cela et voir ce qu'on peut en faire.

Cordialement.

Daniel

Bonjour Daniel,

Lobe est particulièrement facile à mettre en œuvre mais hélas, en Anglais.

Le lien: https://www.lobe.ai/

Bonjour,

Suite au message de Daniel sur l'intelligence artificielle (application LOBE), j'ai effectué des essais avec des images de diatomées que j'avais cumulées entre 2013 et 2016 (suite aux prélèvements du Lac Inlé en Birmanie). Les résultats sont assez intéressants. Car j'obtiens un taux de réussite de 95-96% et donc également un taux d'erreur de 4 ou 5%. Je trouve cela assez précis et pourtant les photos ne sont pas toutes de première qualité... et n'ont pas reçu de traitements préliminaires (la machine fait mieux que moi. Mais je n'ai pas le niveau pour mesurer sa et ma compétence!)
Le logiciel est facile à utiliser, Cela est rapide (sur ma machine i7 8GB, Win10pro, carte graphique 1060, SSD de type NVME, Hardware de 2017 et +)

Je tiens à préciser que j'ai traité 4200 images de diatomées... ! (oui c'est énorme) 34 familles de D.
On peut voir les photos utilisées ici http://pichotjm.free.fr/Docu/Diatomees/2-CaptureDiatomees.php (page très longue à charger car il y a plusieurs milliers de photos. La page semble avoir des pb au début. -Il s'agit de notes non prévues pour Internet mais pour une utilisation locale)
Le logiciel détecte des erreurs, (confusion entre des diatomées) et je ne suis pas assez expert en diatomées pour déterminer si le nom des photos est correct. (la faute du logiciel ou de mes échantillons mal nommés?)
Je pense qu'un expert pourrait facilement renommer des diatomées en litige et faire tomber le taux d'erreurs vers les 2%
Il serait également possible de nettoyer les photos en rendant flou l'arrière plan. Mais cela sera du boulot!
Je pourrais également supprimer des photos douteuses (plusieurs D, présence de sable, ...).

L'appli semble ne pas avoir prévu de sauvegarder le travail !!! J'ai donc peur de faire des ajustement avec le risque de tout perdre.

Pour faire une AI pour des fleurs (ou autres sujets), il faudrait (pour chaque fleur) faire une cinquantaine de photos! (vues du haut, de gauche, de droite , de dessous...) Bouleau important mais pas impossible.

Cordialement

Bonjour à tous,

Merci Jean-Marie pour cet essai qui semble assez intéressant voire concluant.
Tu parles des fleurs, mais cela existe contrairement semble-t-il au plancton.
Ce serait formidable d'intégrer dans l'outil toutes les observations identifiées qui ont été stockées jusqu'à présent sur le forum. Une grosse question ; comment y arriver de façon collaborative.
1) Récupérer ce qui existe déjà.
2) Où stocker la base de données
3) Comment continuer à l'alimenter par la suite.

J'ai beaucoup de questions mais peu de réponses .

Une question de plus pour André. Connaît-on le volume occupé par les clichés publiés dans les collections (Protozoaires, micro-algues, micro-métazoaires) ?

Amicalement.

Daniel

Bonjour,
Je ne suis pas l'actualité sur le plancton, donc je ne sais pas s'il y a suffisamment de clichés pour chaque variétés de planctons. Les infos que j'ai obtenues indiquent qu'il faut au moins 50 clichés par variétés (par label).

J'avais donc collecté plus de 4000 photos de diatomées, et les avais normalisées en 800 px de largeur. Il était très tentant de faire l'essai avec LOBE. Une grande partie du travail étant déjà faite. (pas parfait)
Pour établir cette collection, je mémorisais les photos dès l'apparition sur le site (lors des discussions). J'ai fait cela pendant plusieurs années. Et puis voyant que cela ne servait à rien ... j'ai abandonné. (je peux cependant retrouver les dates exactes de ces collectes) Et est donc possible de reprendre ce travail 'diatomées'. (en analysant avant la date de début, et après la date d'abandon) Cela est faisable pour un groupe 'diatomées'. Je peux expliquer comment normaliser les photos. (voire en automatique pour partie)
Par contre le nettoyage des photos (effacer le sable, ... ) ne peut se faire que manuellement. Et cela demande du temps.
Il faudrait que le nom comporte le nom de l'espèce et un chiffre quelconque (pour éviter les doublons)
Il faut classer les espèces dans des répertoires. En quand un répertoire contient environ 50 photos on peut le faire absorber par LOBE. A chaque introduction de photo (ou renommage) l'AI peut redémarrer à 0 et demander une heure de calcul... donc autant lui donner des lots triés.
Il faut aussi penser à faire valider le travail de classement. Donc repérer toutes les erreurs de tri/nom/espèce...

Il faut une machine pour faire les calculs (apprentissage) et je ne sais pas comment sauver un travail (pour le déplacer sur une autre machine) Je sais par contre comment exporter le travail pour un usage sur le web. Mais je ne sais pas comment écrire la page web correspondante. (ce n'est pas mon métier, ni mon centre d'intérêt)

On pourrait donc s'organiser:
- des bénévoles récupèrent les photos de telle date à telle autre date (de la volonté!)
- nettoient les photos (flous sur les parties inutiles) (de la volonté! du temps, ...)
- Préparent des lots dans des répertoires (facile)
- Envoi à la machine, qui fera une mise à jour de l'AI (facile, la machine existe)
- Diffusion sur le web du résultat (à trouver)

Difficile de parier sur ce genre de coopération...

Je parlais fleurs (comme ça, sans pensées particulières, sauf qu'on prend actuellement des fleurs de printemps. Il y a Sylvain qui est accro ... Perso, j'ai fait 30 fleurs et cela m'a demandé pas mal de temps/stress/boulot ! alors x50 ...

Reste à connaitre le nom des gens intéressés...
Le sujet mérite d'être approfondi.
Cordialement

PS Il faut remercier pierre4fun pour la découverte du logiciel