Tolypothrix et autres cyanobactéries


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Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede André » 21 Aoû 2017 08:11

Bonjour à tous

C'est sur un tronc de Ficus lyrata , dans une serre tropicalisée au jardin botanique de Strasbourg que Bernard Woerly - en étudiant les Myxomycètes - a observé cette cyanobactérie qui se présente sous la forme d'un gazon plutôt bien fourni :

Photo Bernard Woerly

Ficus lyrata Serre tropicale 2017-06-13 09.46.33-2 - copie.jpg
Exif et Meta MicroCartouche Ficus lyrata Serre tropicale 2017-06-13 09.46.33-2 - copie.jpg (208.84 Kio) Vu 5934 fois


A l'examen microscopique on observe une formation filamenteuse constituée de cellules de couleur typique des cyanobactéries.

tolypothrix_sp.jpg44.jpg
Exif et Meta MicroCartouche tolypothrix_sp.jpg44.jpg (106.46 Kio) Vu 5933 fois


La présence d'hétérocystes atteste rapidement cette orientation. Aucun akinète n'est visible.
Une gaine assez épaisse entoure les cellules qui sont plutôt plus larges que longues . :

tolypothrix_sp.jpg1.jpg
Exif et Meta MicroCartouche tolypothrix_sp.jpg1.jpg (94.19 Kio) Vu 5935 fois


Les trichomes présentant de fausses ramifications nous mènent vers la famille des Scytonématacées.

tolypotryx_sp.jpg33.jpg
Exif et Meta MicroCartouche tolypotryx_sp.jpg33.jpg (173.67 Kio) Vu 5935 fois


Ces ramifications étant simples et non géminées , il s'agit du genre Tolypothyx Kützing 1843

La présence d'un hétérocyste à la base des ramifications indiquée par Bourrelly n'a pas pu être observée sur le prélèvement qui m'est parvenu.
Les gaines de couleur hyaline paraissent légèrement stratifiées :

tolypothrix_sp.jpg55.jpg
Exif et Meta MicroCartouche tolypothrix_sp.jpg55.jpg (112.2 Kio) Vu 5936 fois
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede André » 22 Aoû 2017 08:10

Les cellules de cette espèce sont en général plus larges que longues.
Largeur des cellules : 10.6; 11.4; 12.5; 13.3µm; moyenne 12µm
Longueur: 7; 7.2; 7.5; 10.4µm
Largeur avec gaine: 14.6; 13.8; 13.3; 11.6µm; moyenne 13.3µm

L'épaisseur des gaines est inférieure à 2µm.

En prenant en compte les caractères exposés et en suivant la clé de Geitler, on s'approcherait de Tolypothrix byssoidea (Berk.) Kirchn.

Sur le même prélèvement se trouvaient d'autres populations de cyanobactéries dont la suivante qui pourrait correspondre au genre Gloeocapsa , petits coenobes formés de quelques dizaines de cellules, entourés d'une" gelée zonée":

gloeocapsa_sp.jpg
Exif et Meta MicroCartouche gloeocapsa_sp.jpg (91.26 Kio) Vu 5869 fois


ainsi qu'un amas de cellules agglomérée dont le diamètre n'excède pas 3.3µm.

cyanobacteries.jpg
Exif et Meta MicroCartouche cyanobacteries.jpg (147.59 Kio) Vu 5869 fois


B.Woerly étudie les Myxomycètes présents ainsi que les interactions entre ceux-ci et ces cyanobactéries .

Tous les commentaires seront bienvenus.
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard-J » 22 Aoû 2017 11:29

André a écrit:B.Woerly étudie les Myxomycètes présents ainsi que les interactions entre ceux-ci et ces cyanobactéries .

Tous les commentaires seront bienvenus.

La belle couleur des Cyanos !

Bernard Woerly a publié un article intéressant sur les myxos des Vosges du Nord:
http://www.parc-vosges-nord.com/medias/File/_doc_dyn/french/_1-woerly-francais1292261029.pdf
Normalement, j'imagine que les Myxos vont manger les Cyanos, mais les Tolypothrix sont connues pour sécréter des toxines antifongiques et anti-larves de moustique, donc le combat serait passionnant à suivre au MO. Les paris sont ouverts ;)
J'aimerais bien savoir comment il compte faire, a-t-il cultivé des Myxos pour ses manips ?
Merci André pour ce partage.
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard_W » 27 Aoû 2017 09:55

Bonjour,
merci Bernard J. pour ton commentaire.
A priori les Tolypothrix émettent trop de toxines et sont trop bien protégées pour être consommées par les myxomycètes. (La nourriture de base des myxos à l'état plasmode = les bactéries). Par contre dans le mucilage qui entoure ces cyanos ils trouvent sans doute de quoi se nourrir, des bactéries qui leur conviennent mieux ...
Contexte : je fais des inventaires de myxomycètes, entre autres pour le jardin Botanique de Strasbourg. L'inventaire sur le terrain est complété par des prélèvements de substrats potentiellement porteurs de spores ou de sclérotes et mis en culture en chambre humide. Généralement j'obtiens des fructifications au bout de quelques semaines. J'ai prélevé de l'écorce d'un Ficus avec ce que j'ai identifié au départ comme étant une bryophyte ...( désolé, je n'y connais rien en cyanobactéries ! Les spécialistes bryos m'ont renvoyé vers André qui a su faire le bon diagnostic, merci André). Et obtenu très rapidement (5 jours) un Physarum inconnu, l'identification de l'espèce (3 possibilités) est en cours de discussion entre spécialistes. Ci-joint photo.
Suite de l'étude :
- prélèvement d'écorces du Ficus sans cyano : déjà fait sur différentes partie de l'arbre aucun myxo obtenu
- prélèvement des Tolypothrix uniquement : sera fait semaine prochaine
- prélèvement de Tolypothrix sur d'autres arbres de la serre, ou au sol (si j'en trouve !) : sera fait semaine prochaine.
Cela me permettra de voir ce qui fonctionne ou pas pour obtenir le Physarum en question, et cela s'arrêtera là : je n'ai ni les moyens ni les compétences pour effectuer un travail plus approfondi sur ce que consomme effectivement le myxo ...
Cdt, Bernard W.
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BW2517 Physarum cf umbeliciferum 2017-06-04 21.07.19-2 - taille forum .jpg
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard-J » 27 Aoû 2017 19:40

Merci pour ces précisions.
Les Myxos sont des êtres fascinants. Le problème est qu'ils poussent où ils veulent et quand ils veulent et se fichent totalement des vœux de celui qui les étudient. :evil:
J'aime bien voir les myxamibes-myxoflagellés sortir des spores entre lame et lamelle en chambre humide, mais ils n'ont jamais voulu pousser leur cycle plus loin. Tu peux trouver quelques vidéos de mon cru sur ce forum.
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard_W » 28 Aoû 2017 05:46

Oui Bernard, les myxos poussent où ils veulent et quand ils veulent, mais ils ont leurs habitudes qu'on peut connaître à force de les fréquenter ! Toi qui est localisé en Suisse, tu n'as jamais été voir aux abords des plaques de neige fondante vers avril mai ?

Si tu as vu des myxamibes sortir de leur spore (Reticularia lycoperdon sans doute ?) entre lame et lamelle, c'est sous ton microscope et pas dans une chambre humide. Ou bien ?
Si tu veux qu'elles amorcent leur cycle, il faut leur donner la nourriture qui leur convient dans un environnement (humidité) qui leur convient. Le plus simple est alors de prendre dans la nature un substrat potentiellement porteur de spores. Par exemple si tu trouves R. lycoperdon sur un arbre, tu prélèves quelques écorces à proximité immédiate et tu mets en chambre humide. Je n'ai jamais fait, mon truc n'est pas de reproduire ce qu'on peut observer dans la nature, mais de faire apparaitre en chambre humide des espèces qu'on n'aurait pas réussi à voir sur le terrain, car trop petites ou d'apparition trop fugace (pas venu au bon moment). C'est indispensable dans le cadre d'un inventaire. Pour l'instant je mets beaucoup de lianes en chambre humide : Clématites, Lierre, Houblon, etc. Exemple ci-joint d'un Licea eleanorae obtenu récemment sur Houblon après 6 jours de mise en boite. 0,5 mm de hauteur totale, bon courage si tu veux trouver cette espèce directement sur le terrain ;)

Bonne journée à tous.
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard_W » 28 Aoû 2017 05:52

j'oubliais, Bernard, tes vidéos myxos sont où ? trouvé seulement un sujet de toi sur la perception des couleurs. Pas évident de retrouver les choses, pour un débutant sur ce forum aux multiples tiroirs...
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede André » 28 Aoû 2017 07:22

Bonjour à tous, bernard

le sujet de Reticularia est ici : viewtopic.php?f=41&t=15596&p=85395#p85395

Nous avons une rubrique Myxo dans les Collections ( pas encore très fournie) : viewforum.php?f=261

Dans Observations mycologiques : viewforum.php?f=41

Peut être faut il créer un sous forum à part ?
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard-J » 28 Aoû 2017 14:02

Bonjour Bernard, André, tous,


...tes vidéos myxos sont où ? ...

Les vidéos sont sur ma chaîne Youtube ci-dessous. Elles sont le plus souvent en anglais car les visiteurs viennent du monde entier et muettes tant que je n'ai pas réussi à enregistrer la voix des microorganismes; dans ces cas, je déteste toute doublure, musicale ou autre. :mrgreen:
Je les reporte sur ce forum avec quelques commentaires pour les francophones stricts.
Pour les Myxos, regarde la sélection (playlist) "Myxomycetes":
https://www.youtube.com/c/bernardjenni

Toi qui est localisé en Suisse, tu n'as jamais été voir aux abords des plaques de neige fondante vers avril mai ?

Euh..., pas encore, j'y penserai au printemps prochain.

Si tu as vu des myxamibes sortir de leur spore (Reticularia lycoperdon sans doute ?) entre lame et lamelle, c'est sous ton microscope et pas dans une chambre humide. Ou bien ?

C'est effectivement entre lame et lamelle sous le MO. Mais je laisse la lame/lamelle en chambre humide en rajoutant 1-2 gouttelettes d'eau sur les bords de la lamelle pour éviter la dessication et parfois les myxoflagellés sortent après 1-2 jours, parfois jamais. Tu trouveras une photo de chambre humide dans ma toute récente vidéo sur la bactérie Lamprocystis.
Je me demande toujours pourquoi ces spores germent dans ces conditions de confinement entre lame/lamelle et non dans une éprouvette qui devrait aussi présenter une anaérobiose dans le fond. J'aimerais bien connaître ce facteur déclenchant.
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Re: Tolypothrix et autres cyanobactéries

Messagede Bernard_W » 28 Aoû 2017 16:27

Merci André et Bernard pour les liens.

Bravo pour toutes ces vidéos et photos, c'est un domaine que je ne maitrise pas vraiment.

Le capillitium du Stemonitis est particulièrement bien réussi. Pour enlever les spores j'utilise une sarbacane de ma création, stylo bic mine enlevée, et je laisse les myxos sur leur support d'origine, pas besoin de scotch. Elle me permet de ne souffler que l'exemplaire que je veux étudier.

Peut être faut il créer un sous forum à part ?

Un tiroir de plus, au secours ... quoique, je vois que parti des cyanos le sujet a dérivé. Mais il en est souvent ainsi. A toi de voir André ce qu'il convient de faire.

J'aimerais bien connaître ce facteur déclenchant.

De ce que je sais les facteurs humidité et chaleur permettent aux spores de "germer". Pour l'air et la lumière je ne sais pas. Si on veut obtenir des fructifications de myxos en chambre humide, obtenir des amibes sur une lame de microscope ne suffit pas, même si ensuite il y a possibilité de les mettre dans une boite de Pétri. Il faut que des amibes de signe compatible se rencontrent et fusionnent pour faire une cellule oeuf, qui va donner ensuite un plasmode, qui lui même fructifiera, si tout va bien ... Pour tout cela il faut, outre l'ambiance, de la nourriture. Les techniques de laboratoire qui permettent d'apporter la nourriture adéquate selon les espèces me semblent bien compliquées à mettre en oeuvre pour un profane comme moi. Surtout s'il y a besoin en plus d'un milieu stérilisé pour éviter la concurrence. Comme dit, je prends dans la nature le substrat supposé posséder tout le kit nécessaire : spores, nourriture (bactéries), pH adéquat, etc. Je mets dans une boite plastique avec un buvard sensé retenir l'humidité, j'humidifie régulièrement. Quand les moisissures et les larves d'insectes ne s'en mêlent pas trop, çà marche ... Une photo d'un plasmode et début de fructifications, en partie sur le buvard, dans une chambre humide à ma façon, où j'ai placé des strobiles d'aulne glutineux, et qui au final m'a donné de grandes quantités de Craterium concinnum. A +.
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BW2311 C concinnum et plasmode 2016-09-13 16.49.41-2 - taille forum .jpg
Exif et Meta MicroCartouche BW2311 C concinnum et plasmode 2016-09-13 16.49.41-2 - taille forum .jpg (236.79 Kio) Vu 5672 fois
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