Formes et architecture des colonies

[Bernard-J]

Pour ce weekend, j'aimerais vous présenter tout d'abord une boîte de Petri contenant probablement une cyanobactérie (ou une algue-je n'en sais rien- avis d'experts bienvenus - cette photo a 30 ans et je n'ai pas les résultats d'observations au microscope). Dans ce cas, il est bien difficile de parler de colonie(s)! J'imagine des cellules filamenteuses collées les unes contre les autres et glissant (gliding) sur l'agar au cours de leur croissance. Ces formes m'avaient fascinés et me fascinent toujours aujourd'hui.

EDIT, le 18.déc.2016: Cet organisme pourrait bien être la cyanobactérie Oscillatoria animalis. Elle ressemble beaucoup à celle-ci: https://exploringtheinvisible.com/2016/12/15/for-christmas-a-bacterial-love-story-the-incredible-journey/

algue-BdP.jpg (45.67 Kio) Vu 6869 fois

scan -zoom-BdP.jpg (55.85 Kio) Vu 6868 fois

Ensuite, afin de passer de la dimension 2D à 3D, voici une star dans le monde des bactéries: Bacillus subtilis.
Cette vidéo (en anglais-désolé) explique que les colonies fraîchement isolées de l'environnement - ici par filtrage d'eau sur un filtre 0.45 microns - forment des colonies très structurées. Ces structures se perdent quand les souches sont domestiquées, c'est-à-dire repiquées régulièrement au labo. Pour former de telles structures, il existe plusieurs "types" de cellules dans la colonies, qui sont en quelque sorte spécialisées. La deuxième vidéo explique mieux cet aspect. L'on devrait ainsi considérer ces colonies comme des organismes multicellulaires plutôt qu'un simple amas de bactéries individuelles. Quand les substrats nutritifs sont épuisés, une partie des cellules sporulent, d'autres meurent, nourrissant ainsi d'autres confrères (cannibalisme !) qui pourront ainsi avoir l'énergie de migrer afin d'essayer de trouver d'autres ressources. A la fin de la première vidéo, l'on voit la fascinante construction architecturale élaborée par ces bactéries tout autour du filtre.




Voilà, J'espère que je n'étais pas trop long...
Bon weekend à tou(te)s.

[AMechineau]

Bonjour,
c'est vraiment impressionnant ! Je n'aurais pas pensé qu'il puisse y avoir des interactions aussi marquées chez les bacilles !

[PPH78]

Bonjour

Ta photo m'intrigue, de part ma formation de base, je pense que j'ai vu beaucoup de colonies et de développement sur gélose, mais je n''ai pas de souvenir de développement bacterien qui aurait cette forme. (Ou alors lorsque celle-ci dégénère en raison du traitement physique ou chimique)

Je pense plutôt pour des algues (pourquoi pas des cynabacteries) ou des moisissures.

Je vais regarder dans mes bouquins et mes photos mais de mémoire je n'ai pas souvenir de ce type de colonies.

Les colonies se développent de façon différente avec une présentation qui dépend du milieu (gélose) des composants, du type de respiration, et des interactions avec d'autres bactéries et autres (levures, champignons, bactériophages,..)
A l'époque pour la petite histoire, j'avais le projet de faciliter la reconnaissance des bactéries par analyse d'images et par analyse olfactive, mais comme les même bactéries peuvent apparaitre sous des formes différentes le projet n'a pas abouti.

Cordialement

Patrick

NB Je continue de chercher parce que cela m'intrigue

[Bernard-J]

de AMechineau » 17 Mai 2014 16:19
bonjour,
c'est vraiment impressionnant ! je n'aurai pas penser qu'il puisse y avoir des interactions aussi marquée chez les bacilles !

Bonjour,
c'est effectivement très impressionnant et mal connu. J'ai posté ce message pour cette raison. Le phénomène de "domestication" des souches bactériennes pose la question de la pertinence de certains résultats obtenus avec les souches repiquées pendant des années au labo pour une extrapolation à ce qui se passe dans les milieux naturels. De plus, au vu de ces connaissances, la notion d'organisme est intéressante. Il semble bien qu'avec B. subtilis, la colonie doit être considérée comme l' "organisme" et non la cellule bactérienne.
Cordialement

[Bernard-J]

Réponse à PPH78 » 18 Mai 2014 11:03

Merci pour la visite !
La photo au début de mon message est clairement une algue ou cyanobactérie. Cette souche a d'ailleurs été isolée lors d'une campagne de recherche d'algues, probablement pour l'enseignement, il y a très longtemps...

Les films montrent Bacillus subtilis. Ces colonies ont été analysées et identifiées comme B. subtilis par spectrométrie de masse (MALDI-TOF). Visitez http://www.mabritec.com pour plus d'info.

[Bernard-J]

Bonjour,
Je me dois de retirer ce fil des tréfonds du forum afin de vous communiquer ma dernière trouvaille sur la toile.
En effet, Cette belle "colonie" sur agar pourrait bien être la cyanobacterie Oscillatoria animalis.
Regardez ici, c'est magnifique:
https://exploringtheinvisible.com/2016/12/15/for-christmas-a-bacterial-love-story-the-incredible-journey/
Et en prime comme bizarrerie biologique, un amas de cellules coupé en deux et séparés sont capables de se regrouper!