Gomphonema acuminatum est une diatomée d'eau douce présentant un bord de valve onduleux. Le sommet de la valve largement dilaté est surmonté d'une sorte de téton. L'extrémité inférieure est effilée. Les stries au nombre de 10/10 µm sont nettement ponctuées et légèrement radiées au centre. Deux stigmas en prolongement des deux stries courtes centrales sont présentes. Le raphé est légèrement sinueux.